A composição societária da Hidroerg assenta em três núcleos: os quadros técnicos portugueses, diretamente envolvidos na gestão e atividade diária da Empresa, nos vários domínios em que esta atua; uma sociedade de direito alemão, igualmente ligada à produção de eletricidade naquele país; e uma empresa de direito português mas base acionista austríaca, inserida num dos maiores produtores e distribuidores de energia daquele país.

A orgânica interna da Empresa subdivide-se fundamentalmente em duas áreas: os serviços centrais, onde se elaboram múltiplos estudos, se encaminham processos de licenciamento, se gerem empreitadas e fornecimentos, se acompanha remotamente o funcionamento das centrais e se asseguram todos os serviços de escritório; e os centros electroprodutores, onde se efetua a operação e manutenção das centrais em regime de proximidade.

A gestão da sociedade está confiada a um Conselho de Gerência composto por três membros, eleitos em Assembleia Geral e mandatados por períodos trienais. O desenvolvimento da atividade assenta num conjunto de colaboradores com relevante especialização nas áreas envolvidas na concretização do objeto social da Empresa.

A Hidroerg atua individualmente e por meio das suas participadas Lusiterg, Atberg e Ruiverg. Estas empresas, constituídas respetivamente em 1995, 2001 e 2015, assumem um perfil de veículo de investimentos, sendo sociedades em muito apoiadas na atividade da própria Hidroerg, com a qual partilham objetivos empresariais. Cada uma das empresas detém os seus próprios centros electroprodutores.